Geneious 10是一款专业的生物信息学软件,是9的升级版本,该软件用户提供了两个版本,一个是基本版本一个是增强版本,功能上有所差异,不过对于普通用户来说功能已经足够用了,Geneious 10为使用者提供了序列比对、序列观看、PCR引物设计、蛋白质结构查看、互联网协作等多种功能,欢迎有需要的朋友们前来下载使用。
Geneious 10特色
Geneious结合了所有主要的生物信息学分析工具。 Geneious提供一个免费的学术使用的基本版本,一个提供更多功能的付费商业增强版本.
序列比对和序列观看
Motif搜索和开放读码框(ORF)
进化树建设UPGMA,NJ bootstrapping和consensus trees
Contig assembly和色谱编辑
限制性内切酶分析
PCR引物设计
蛋白质结构的观看
整合数据库-集成检索与GenBank,PubMed,BLAST和UniProt
通过互联网协作和共享数据
生物信息教学-创建教程与直接联系的材料
公共API开发,由社区开发的生物信息学的免费插件
各种标准的生物信息学等应用工具ClustalW,MrBayes,EMBOSS,PAUP和Mauve。
安装教程
1、解压后双击“Geneious_win64_10_2_2_with_jre.msi”开始安装

2、点击next如下图,在我同意协议前打勾

3、设置软件安装目录,默认位置为“C:\Program Files\Geneious\”

4、设置软件的关联文件,我们可以保持默认

5、建立桌面图标

6、如下图,点击install安装即可

使用说明
1、打开geneious

2、初始界面如下图:

3、Alignment可用于比对,tree建树,assembly拼接。 序列拼接
右键点击local,创建新文件夹,测序公司提供*.abi格式文档,可直接拖动,或者file-import。 导入完成后结果如图

4、为了准确可再次导入一个参考序列。

5、选择需要拼接的序列和参考序列进行assembly,(示例:DTH8和DTH8-13F/R),弹出窗口

6、参考序列为DTH8(自动识别),选择不要剪切----ok。拼接完成图

7、按住ctrl,向上滚动鼠标即可放大,与参考序列一致颜色不变

8、与参考序列不一致颜色蓝色

9、此时选择上面的峰,第一个不一致处,多出一个G,点击allow editing,光标变为绿色,将其放在consensus上,删除“-”

10、下面一行的G则被删除,序列校正过后再点击allow editing,如图

11、下一处不同竖着看--A--A---,选择A,不需要修改。
整个序列校正完毕后,点击save

若需要导出序列选择consensus,全选该序列,点击file-export-selected documents

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